Résumé
Des années ont passé après les aventures de Yugi et maintenant c'est au tour de Yuki Judai. Yuki Judai est un nouvel élève de l'école Duel Academy, une école dédiée à enseigner aux duellistes les bases et les techniques avancées. Judai est déterminé à être le duelliste n ° 1 mondial, acceptant les défis de ses rivaux (et amis). Bien que le manga soit basé sur l'anime, l'histoire est vraiment différente et sans rapport.