Résumé
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Le manga Onmyou Taisenki ne raconte pas la même histoire que l'anime. L'histoire se déroule des années avant les événements de l'anime.
Le personnage principal, Yakumo (qui apparaît également dans l'anime, adolescent) est le fils de Monju, le prêtre chef du temple Taihaku, à Kyoto. Yakumo entraîne également le In, avec une balle de baseball. Dans ce temple, un Toujinshi (闘神土, littéralement « dieu de la guerre ») et ancien professeur de Monju, Mahoroba, est emprisonné.
Les problèmes commencent lorsque Mahoroba s'échappe, prend le pouvoir et transforme Monju en pierre. Yakumo est appelé par un Zero Drive, qui était l'un des trésors du temple. Ce Zero Drive gère Byakko no Kogenta. L'histoire du manga raconte les premiers pas de Yakumo avec un Shikigami, son entraînement avec Idzuna (la jeune fille du sanctuaire du temple Taihaku) et sa recherche de Mahoroba à travers diverses dates historiques japonaises. Des personnages historiques japonais célèbres tels qu'Oda Nobunaga peuvent être vus sur le manga.