Résumé
L'histoire se déroule dans un futur lointain.
La terre est en ruine et l’humanité établit la ville fortifiée mobile Plantation. Les pilotes produits à l’intérieur de Plantation vivent à Mistilteinn, également connue sous le nom de « cage à oiseaux ». Les enfants y vivent sans connaître le monde extérieur ni la liberté du ciel. Leur vie consiste à se battre pour accomplir des missions. Leurs ennemis sont de mystérieuses formes de vie géantes connues sous le nom de Kyōryū, et les enfants pilotent des robots appelés Franxx pour les affronter. Pour les enfants, monter sur le Franxx prouve leur existence. Un garçon nommé Hiro s'appelle Code:016 et il était autrefois connu comme un prodige. Cependant, il a pris du retard et son existence semble inutile. Ne pas piloter un Franxx équivaut à cesser d’exister. Un jour, une mystérieuse fille connue sous le nom de « Zero Two » apparaît devant lui. Deux cornes sortent de sa tête.